Фамилия Мухин относится к разряду наследственных именований, образованных от мирских имен. После принятия христианства на Руси официальными стали крестильные имена из церковных святцев. Однако они поначалу были непривычны славянскому уху, часто повторялись и вносили путаницу в распознование людей. Поэтому до XVII века сохранялась древняя традиция наречения мирскими именами, которые выделяли особенности характера или внешности человека. Прозвище Муха было довольно распространено среди всех слоев населения, ведь мухи досаждали и боярам, и холопам, и священнослужителям.
Варианты происхождения фамилии.
Вряд ли какое-либо другое насекомое пользовалось такой «популярностью», как муха. В древности даже существовал шуточный обряд «похороны мух», который олицетворял проводы старого года («Злую муху в землю осенью закопать – в новом году прочие кусать не будут»). Скучный человек – «мухи дохнут», кроткий – «мухи не обидит», выпил – «под мухой», бездельник – «считает мух», расторопный везде «мухой успевает». По разным причинам присваивалось прозвище Муха. В летописях упоминаются – землевладелец Ивашко Муха (1504 г.), митрополичий дьяк Васюк Муха (1526 г.), крестьянин Мушка Филиппов (1539 г.), московский дворянин Муха Васильев сын Чихачев (1566 г.). К имени детей Мухи прибавлялись отчества «Мухин сын» и «Мухина дочь», откуда фамилия Мухины берет свое начало. Происхождение фамилии Мухин документально зафиксировано в середине XVI века – до нас дошли сведения о московском дворянине Василии Петрове сыне Мухине Карпове (1566 г.), новгородце Первом Степановиче Мухине (1600 г.), чердынце Фролко Мухине (1623 г.), московском дьяке Павле Мухине (1693 г.).
В наши дни сложно определить, что означает фамилия Мухин в конкретном случае. Необходимо обладать достаточными сведения о родоначальнике, знать, каким он обладалал характером, чем занимался, как выглядел и где проживал. Значение фамилии Мухин может зависеть от названия места, откуда был родом ее первый обладатель. Так, выходцы из поселений Мухово, Муха могли стать Мухиными, когда всех жителей Российской империи в 1888 году обязали обзавестись фамилиями.